自然界不同物種或個體之間的基因轉(zhuǎn)移和重組是經(jīng)常發(fā)生的,它是基因變異和物種進化的基礎(chǔ)。自然界的基因轉(zhuǎn)移的方式有：

　　接合作用：當細胞與細胞、或細菌通過菌毛相互接觸時,質(zhì)粒DNA就可從一個細胞（細菌）轉(zhuǎn)移至另一細胞(細菌）,這種類型的DNA轉(zhuǎn)移稱為接合作用（conjugation ）。

　　轉(zhuǎn)化作用（transformation) 通過自動獲取或人為地供給外源DNA,使細胞或培養(yǎng)的受體細胞獲得新的遺傳表型。

　　轉(zhuǎn)導(dǎo)作用：當病毒從被感染的（供體）細胞釋放出來、再次感染另一（受體）細胞時,發(fā)生在供體細胞與受體細胞之間的DNA轉(zhuǎn)移及基因重組即為轉(zhuǎn)導(dǎo)作用（transduction）。

　　轉(zhuǎn)座：大多數(shù)基因在基因組內(nèi)的位置是固定的,但有些基因可以從一個位置移動到另一位置。這些可移動的DNA 序列包括插入序列和轉(zhuǎn)座子。由插人序列和轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)的基因移位或重排稱為轉(zhuǎn)座（transposition ）。

　　基因重組：在接合、轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)導(dǎo)或轉(zhuǎn)座過程中,不同DNA分子間發(fā)生的共價連接稱基因重組。基因重組包括位點特異性的重組和同源重組兩種類型。有整合酶催化的在兩個DNA序列特異位點間發(fā)生的整合,產(chǎn)生位點特異的重組。特異重組依賴特異的DNA序列,如λ噬菌體的整和酶可識別噬菌體DNA和宿主染色體的特異靶位點,并進行選擇性整合；反轉(zhuǎn)錄病毒整合酶識別整合反轉(zhuǎn)錄病毒cDNA的長末端重復(fù)序列等。另外有發(fā)生在同源序列間的同源重組,又稱基本重組。同源重組依賴兩分子間序列的相同或相似性,將外源DNA整合進宿主染色體。